El sueldo para los magistrados de la JEP, el cual fue definido por el presidente Juan Manuel Santos, será uno de los más altos que reciba un funcionario en el país. El decreto que lo cobija es el 1760 de 2017 y fue firmado por la directora del Departamento Administrativo de la Función Pública, Liliana Caballero, y los ministros de Hacienda, Mauricio Cárdenas, y Justicia, Enrique Gil.
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De acuerdo a lo que afirmó Caracol Radio, el secretario ejecutivo y los miembros del Tribunal de Paz tendrán un sueldo que estará alrededor de los 26 millones de pesos, mientras que los magistrados de las salas (De Responsabilidad y de Determinación de los Hechos y Conductas, De Definición de las situaciones jurídicas, De Reconocimiento de Verdad y De Amnistía o Indulto) y la Unidad de Investigación y Acusación tendrán un salario alrededor de los 18 millones.
Actualmente los magistrados ganan 6.7 millones de pesos, más una prima técnico de 3.7 millones y otra prima especial de servicios.
