Los equipos colombianos tendrán como rivales en los dieciseisavos de final los siguientes equipos, luego del sorteo que definió los cruces de la Copa Sudamericana 2017:
- Llave 1: Racing (ARG) vs Independiente Medellín (COL)
- Llave 2: Deportivo Cali (COL) vs Junior (COL)
- Llave 3: Palestino (CHI) vs Flamengo (BRA)
- Llave 4: Nacional Potosí (BOL) vs Estudiantes (ARG)
- Llave 5: Independiente (ARG) vs Deportivo Iquique (CHI)
- Llave 6: Bolívar (BOL) vs Liga de Quito (ECU)
- Llave 7: Ponte Petra (BRA) vs Sol de América (PAR)
- Llave 8: Fuerza Amarilla (ECU) vs Independiente Santa Fe (COL)
- Llave 9: Huracán (ARG) vs Libertad (PAR)
- Llave 10: Sport Recife (BRA) vs Arsenal (ARG)
- Llave 11: Fluminense (BRA) vs Univ. Católica (ECU)
- Llave 12: Oriente Petrolero (BOL) vs Tucumán (ARG)
- Llave 13: Nacional (PAR) vs Olimpia (PAR)
- Llave 14: Defensa y Justicia (ARG) vs Chapecoense (BRA)
- Llave 15: Cerro Porteño (PAR) vs Boston River (URU)
- Llave 16: Patriotas (COL) vs Corinthians (BRA)
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